代谢组数据分析九:相关性分析(spearman)

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介绍

在代谢组学研究中,探究代谢物与临床指标之间的相关性是揭示疾病机制和发现潜在生物标志物的关键步骤。通常,为了解析哪些代谢物与特定疾病存在关联,研究者会采用统计方法来量化这种相关性。Spearman相关系数是一种常用的非参数统计方法,适用于评估两个变量之间的等级相关性,即使数据不满足正态分布或线性关系不明显的情况。

Spearman相关系数的计算基于变量的等级而非实际值,它测量了两个变量的等级之间的单调性关系。如果两个变量的等级呈现出单调递增或递减的关系,它们的Spearman系数将接近+1或-1,表明强正相关或强负相关;如果接近0,则表明没有明显的相关性。

进行代谢物与临床指标的相关性分析时,研究者首先会收集相应的代谢组数据和临床指标数据,然后对数据进行适当的预处理,包括数据清洗、标准化等步骤。接下来,利用Spearman相关系数对每一对代谢物和临床指标进行相关性评估。通过设置显著性水平(如p < 0.05),可以识别出统计学上显著相关的代谢物,这些代谢物可能与疾病的发展或进程有密切联系。

我们采用热图展示代谢物和临床指标的相关性。

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