生信技能47 - Shell程序和R程序并行执行处理方法

Linux shell和R程序并行化执行程序方法。

1. 使用do{…} &;done;wait语句并行执行Shell

并行执行总运行时间不再是task数量*单个任务消耗时间，而是取决于单个耗时最长的任务。

# while循环，遍历test.txt文件每行
cat test.txt|while read i;
do
        time_stamp=$(date "