用GDC Data Transfer Tool下载TCGA数据集Failed问题

已于 2025-02-07 15:06:15 修改
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文章标签： 数据集 TCGA GDC数据集下载工具
于 2025-01-21 19:56:47 首次发布
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首先TCGA数据集我是跟着这位博主的教程下载的，附链接最新TCGA数据库下载教程 - 知乎，筛选到所需数据后，因直接下载数据量太大，所以需要在下载完Manifest文件之后下载GDC Data Transfer Tool工具来下载数据，这时候只需要这个工具软件和Manifest文件即可。

我遇到的第一个问题：出现Error:Invalid or unsupported zip format.No END header found Close all instances and restart please.

显示压缩文件有问题，但我是从官网下载的，并且重启后这个Error还是会出现，但其实并不影响下载。

第二个问题就是出现下载失败的情况，Log日志文件（怎么看日志文件在下文）显示一堆乱码还有一部分是一串文件路径和gdc-client.exe download......类似下边这句，其实这是GDC Data Transfer Tool_UI版本的自动命令执行，查看发现该文件路径下没有gdc-client.exe这个执行程序，这时候就需要去官网下载GDC Data Transfer Tool_Client版本（GDC Data Transfer Tool不同版本看下文），我下载的是gdc-client_2.3_Windows_x64

解压之后将gdc-client.exe这个执行程序拷贝到报错路径里，同时将gdc-client.exe这个执行程序所在的路径添加到环境变量里，就可以成功下载了

查看Failed日志文件

GDC Data Transfer Tool不同版本：建议下载UI版本，操作简单

第三个问题是有几个文件反复尝试下载还是失败，如果文件个数较少的话可以去官网手动下载，只需要复制UUID号，在官网搜索栏搜索并下载即可，这个UUID显示不完整的话就打开日志文件找到UUID并复制

_CYY_
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