研究前沿|NAR:一个综合性的植物代谢组数据库

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引言

2023年10月,华中农业大学小麦改良创新团队陈伟教授课题组在Nucleic Acids Research发表题为“PMhub 1.0: a comprehensive plant metabolome database”的文章,系统介绍了他们开发的植物代谢分析网站(PMhub)的功能与价值。PMhub数据库通过整合公共质谱数据、自己的多种植物代谢质谱数据、转录组数据和基因组数据等,为研究人员提供植物代谢物查询、代谢物结构解析、代谢物网络分析和代谢物遗传分析等功能(图 1)。

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图1 PMhub的主要功能以及流程

数据库介绍

数据库信息总结

    PMHub(https://pmhub.org.cn)包含了从不同来源收集的188,837种植物代谢物的化学数据,以及与这些代谢物相对应的1,467 ,041个标准/硅内高分辨率串联质谱仪(HRMS/MS)光谱。除了其广泛的文献衍生数据,PMHub还拥有相当大的实验代谢物集合&#

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