引言
2023年10月,华中农业大学小麦改良创新团队陈伟教授课题组在Nucleic Acids Research发表题为“PMhub 1.0: a comprehensive plant metabolome database”的文章,系统介绍了他们开发的植物代谢分析网站(PMhub)的功能与价值。PMhub数据库通过整合公共质谱数据、自己的多种植物代谢质谱数据、转录组数据和基因组数据等,为研究人员提供植物代谢物查询、代谢物结构解析、代谢物网络分析和代谢物遗传分析等功能(图 1)。
图1 PMhub的主要功能以及流程
数据库介绍
数据库信息总结
PMHub(https://pmhub.org.cn)包含了从不同来源收集的188,837种植物代谢物的化学数据,以及与这些代谢物相对应的1,467 ,041个标准/硅内高分辨率串联质谱仪(HRMS/MS)光谱。除了其广泛的文献衍生数据,PMHub还拥有相当大的实验代谢物集合&#