干细胞相关的数据库 小笔记

最新推荐文章于 2022-10-22 20:41:28 发布
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分类专栏： 专业小笔记
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版权

 

大部分还是转录组数据，可供查询，HipSci 数据可以下载。

StemMapper

Gene expression data

http://stemmapper.sysbiolab.eu/

ESCD

CHIP seq & Expression data

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0010709

StemCellCKB

Compound, target, pathway

https://www.cbligand.org/StemCellCKB/mainpage.php

HipSci

WGS, WES, RNA seq, Proteomics

http://www.hipsci.org

ESpress

Gene expression in mouse ES cell

https://www.ebi.ac.uk/teichmann-srv/espresso/index.php

Hematopoietic stem cell

mRNA-miRNA

http://stemniche.snv.jussieu.fr/

细雨春风
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单细胞测序学习笔记（二）——细胞注释
weixin_63756017的博客
02-25 1万+
1.细胞鉴别 在上一步对各类细胞进行featureblot后，可以根据文献或者在线数据库来对细胞进行鉴别。此处我使用的是CellMarker网站。 对照起来进行鉴别，但是有些细胞簇有两个marker，有些细胞簇的marker有重合，所以鉴别这一步具有比较大的主观性，需要结合多个数据库或者文献进行判断。 在完成鉴别后，创建一个新的字符向量保存细胞名称，顺序从0-12一一对应。 以下是我自己的判断结果： new.cluster.ids <- c("Memory T cell","C..
阅读笔记15：The functional landscape of the human phosphoproteome
最新发布
wxw060709的专栏
04-18 704
研究提供了一个系统的方法来评估磷酸化位点的功能重要性，并创建了一个资源，以支持对几乎所有细胞过程中涉及的蛋白质调控的研究。尽管存在一些局限性，如功能得分可能未能完全准确地反映所有调控性磷酸化位点的重要性，但该方法为未来的功能研究和潜在的临床应用提供了重要的工具和数据支持。
干细胞数据库
m0_46336667的博客
09-20 545
干细胞数据库收集
Nature | 干细胞图片数据库共享，深度学习预测细胞外观
weixin_34032621的博客
05-19 433
据Nature最新报道，艾伦细胞科学研究所（Allen Institute for Cell Science）今天发布的网站Allen Cell Explore，包含数千个干细胞的三维立体图像，不止是发现每个细胞的独特外观，通过深度学习算法，该研究所还对细胞的外观进行了预测。改变一个基因对细胞整体而言，如同一场正在进行的球赛换了球员，细胞的命运或...
基因在细胞系当中的表达数据库，CCLE使用简述
leroylee7的博客
01-29 1万+
相信大家都听说过CCLE（Cancer Cell Line Encyclopedia）。简单来说，这个数据库做了很多细胞系当中基因表达、突变、拷贝数以及DNA甲基化的结果。利用这个数据库我们可以了解一个细胞系当中某一个基因的基本情况。那么这么丰富的数据要如何使用呢？下面我们简单介绍一下。 根据官网链接进入主页面，如下图所示：输入基因名或者细胞系名后检索即可。 这里我们以基因YTHDF1为例，输入后提交。 可以看到YTHDF1的相关信息简介及通往其他外部gene数据库的链接。 ...
常用的医学组织切片细胞图像数据集
new_0428的博客
10-22 1万+
乳腺癌细胞图像数据集、血细胞图像数据集、HE染色切片、疟疾细胞图像 图像识别、分类、分割
mapper.xml里面sql写错了的报错信息
qq_820629211的博客
08-05 816
严重: Servlet.service() for servlet [springmvc] in context with path [/mavenzhenghe] threw exception [Request processing failed; nested exception is org.mybatis.spring.MyBatisSystemException: nested exc...
范宇飞主任：干细胞治疗肝硬化前景光明，但仍需继续研究
a15601161042的博客
11-21 1052
范宇飞主任，河北医科大学肿瘤学硕士，北京燕化医院国际部主任医师，中国康复技术转化及发展促进会精准医学与肿瘤康复委员会委员，在肿瘤学、内科学、免疫治疗、干细胞治疗等领域有较为深入的研究。
CS229笔记
youyoudao
03-24 1240
文章目录1 Introduction1.1 What is Machine Learning1.2 Supervised Learning 1 Introduction 1.1 What is Machine Learning ML ： grew out of work in AI(产生于AI) new capability for computers ML Examples: dat...
GEO学习笔记-P3 表达矩阵过滤
weixin_47855187的博客
04-01 2354
学习材料：【生信技能树】公共数据库挖掘实例（基于R语言） bilibili版本以及后续更新课程中的github材料为基础。 本章节是以：【生信技能树】公共数据库挖掘实例（基于R语言）为基础，进行的代码复现与注释，章节标注以之为准。 【生信技能树】公共数据库挖掘实例（基于R语言）_哔哩哔哩_bilibili今天小编给大家带来的是由我们jimmy大大亲自录制的公共数据库挖掘实例~纸上得来终觉浅，绝知此事要躬行，一起跟着大大来实践吧~https://www.bilibili.com/video/BV1Lt4.
《基因大数据智能生产及分析》笔记
公众号/简说基因，知乎/简宝玉
11-12 6931
基因慧的行业报告整体上不错，这次《基因大数据智能生产及分析》也不例外，一口气读完，感受是智能化是行业趋势，打工人的日子更难了。文章有点长，没时间看的话你可以拉到文后看我的一点感想。序言陈...
干细胞领域知识发现平台
qq_42006144的博客
11-30 289
干细胞领域知识发现平台
微信小程序的笔记记录
caiyan851225的博客
02-21 411
const util = require('utils/util.js') //引入其他js //app.js App({ mainUrl: &amp;quot;https://xxx/&amp;quot;, // ajax请求地址 onLaunch: function () { //小程序版本更新提示 const updateManager = wx.getUpdateManager() ...
graphpad细胞增殖曲线_【科普】 干细胞多久见效？持续时间多久？
weixin_36176188的博客
12-15 1338
干细胞多久见效？持续时间多久？首先，每个人的应用情况是不同的，有些是亚健康(症状不一样)、有些是疾病(病种不一样)，其中又涉及到性别、年龄、地域、遗传、单病种和多病种、疾病进展状况等等的因素，造成个体之间的差异千差万别。其次，输注方式是不同的，动脉、静脉、局部注射以及是否联合其它疗法等。再次，生活方式和作息习惯也会对进入体内细胞的生存率和活性产生影响。最后，使用的细胞类型、细胞数量、间...
常用公共数据集
热门推荐
weixin_41036461的博客
06-12 5万+
原文链接：http://homepages.inf.ed.ac.uk/rbf/CVonline/Imagedbase.htmCVonline：图像数据库(Google直译的结果，希望对大家有帮助)按主题索引行动数据库属性识别自主驾驶生物/医药相机校准脸和眼/虹膜数据库指纹一般图像一般RGBD和深度数据集一般视频手，掌握，手动和手势数据库图像，视频和形状数据库检索对象数据库人（静），人体姿势人员检测...
生物信息学数据库_寻找生物数据集来激发您的下一个生物信息学项目
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生物信息学数据库Bioinformaticians provide irreplaceable expertise across the field of biology. It’s no surprise that universities offer more and more opportunities for students to learn these techniques. Whil...
人造细胞能模仿天然细胞感知环境
人工智能学家
08-05 376
来源：科技日报据英国帝国理工学院官网近日消息，该校一个研究团队成功开发出一种新型人造细胞，能够模仿天然细胞感知环境中的化学变化并产生反应。如果在未来发展成熟，这项技术可广...
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