利用MS 构建Na2CO3溶液

1.  在 Project中首先添加3个 3D Atomistic.xsd文件,并将其分别改名为Na.xsd、H2O.xsd、CO3.xsd,并在*.xsd文件中分别创建钠原子,水分子,以及碳酸根离子 (建模前确定水分子的氢氧键长,碳酸根中的碳氧键长)

2. 点击Modules-->Amorphous cell -->Calculation

3. 出来界面中task默认为Construction不做修改,点击后面的More-->Lattice type 中选择Orthorhombic (一般所使用的模型均为正交型,故选此);Length修改a,b的值,对应其他模型的长与宽(我所使用的一般对应C-S-H)

4. 修改density,对应相应浓度溶液的密度。

5.Options..一般我会修改Loading steps,改长一些,出错的概率会小一些,然后Check close contacts 一般我也会勾选上。refinement 中的optimize geometry不勾选,那么所构建体系中的各原子间的键长就会和初始的.xsd文件中的相同

6. Composition 中Molecule将之前所创建的三个.xsd文件依次加入到里面,然后修改Loading的数量,其浓度是通过控制Weigjt%所实现的,在特定浓度下,溶液中相对应的离子weight比例是个定值。

7. 因为所创建的是碳酸钠溶液,所以力场选择的是COMPASS II,通过点击More, 从而对之前所创建的三个.xsd中的相应原子进行手动力场参数类型手动赋值,(此步需要取消勾选Calculate automatically,list all forcefield types(也可不取消这个,但是找的时候会麻烦些))

8. 修改后electrostatic 选择Ewald。

9. Job Control 中可以不做修改, 然后点击run就可以了

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