NCBI中各个符号代表意思

最新推荐文章于 2024-09-02 08:17:49 发布
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分类专栏： 生信 数据库 文章标签： 生物信息学
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本文链接：https://blog.csdn.net/dujidan/article/details/119005574
版权

GCF是RefSeq，GCA是GenBank，GCF可能更可靠一些
F 代表这个地方的是 reference sequences；A 代表这个地方的是 Assembly
ACCESSION是NCBI序列数据中我们常用到编号（另一个是GI）
gi genebank id

一切皆是映射：AI Qlearning在生物信息学中的可能
AI天才研究院
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《一切皆是映射：AI Q-learning在生物信息学中的可能》 关键词 AI, Q-learning, 生物信息学，基因组数据分析，蛋白质结构预测，生物网络分析，映射，机器学习算法 摘要 本文旨在探讨人工智能中的Q
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wangprince2017
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参考基因组 rockygao·2019年12月09日· 201 次阅读 目 在学习进行人的 RNA-SEQ 数据分析之前，需要做许多准备工作： 分析环境的搭建以及各个分析软件的安装； 参考基因组的选择； 待分析数据准备； 分析流程 本文章主要介绍参考基因组选择、不同数据中参考基因下组载，以及参考基因组格式说明。 参考基因组及注释文件 参考基因组文件 通常是 fasta 或者 fasta 格式：以>开头的行标注染色体信息，后续行为该条染色体的碱基信息。 基因注释文件 ...
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ncbi批量下载蛋白序列和基因序列
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这个包提供根据assession number来批量下载多条序列，如果各位想知道具体用法，可以--h看看功能，我这里就不具体阐述；ncbi虽然有提供批量下载蛋白序列和基因序列的方法，但是一次性最多好像只能下载300条序列，，但是对于我们生信分析来说，有点不够用了，因为平时 可能需要下载几百、上千条序列；这就是批量下载基因序列和蛋白序列得方法了，如果有啥问题，可以留言，我会及时回复得！如果去ncbi下载，得下到猴年马月去，所以果断使用python脚本来获取；我们这里可以看到总共需要300多万的序列；
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antiSMASH数据库：微生物次生代谢物合成基因组簇查询和预测2017年4月28日，核酸研究(Nucleic Acids Research)杂志上，在线公布了一个可搜索微生物次生代谢物合成基因组簇的综合性数据库antiSMASH数据库 4.0版，前3版年均引用250次，累计引物1600+；可实现基因组与基因组之间的相关天然产物合成基因簇的查询和预测。核酸研究杂志上，在线公布了一个可搜索微生物次生代
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