1. Intro
选择压力(
Selective pressure
),又称进化压力,指外界施与一个生物进化过程的压力,从而改变该过程的前进方向,所谓达尔文的自然选择,或者物竞天择、适者生存,即是指自然界施与生物体选择压力从而使得适应自然环境者得以存活和繁衍。
1.正向选择
如果某DNA突变对于生物是有益的,对这个突变的选择就是正向的(Positive selection
)。根据有益优势水平的不同,这个有益突变在正面选择下在种群中广泛存在需要不同的时间,短的可以是几代,长的可以上成千上万代。
2.负向选择
(纯化选择
)
如果某DNA突变对于生物是有害的,对这个突变的选择就是负向的(Negative selection
)或纯化选择(Purifying selection
)。理论上,纯化选择将消灭群体中的有害突变。但是轻微有害突变的命运则没有那么明确。
3.中性选择
如果某DNA突变对于生物体没有影响,或影响不明显,对这个突变的选择就是中性的(Neutral selection
)。
2. 选择压力分析note1
原始群体中,遗传多样性是十分高的,整个序列的核酸diversity都高。而在受到选择之后,diversity会发生波动。核酸多样性下降 可能就是由于under selection导致的。
在演化/驯化过程中,如果某一基因X占优势,即X的基因型占据主导地位,则基因X所在区域的杂合率/多样性会显著下降。本质就是 比较基因组不同区域多样性(杂合率)的变化