两个基因相关性CPTAC蛋白组数据

目录

蛋白数据下载

①蛋白数据下载

1，TCGA-选择泛癌数据

 2，TCGA-TCPA

3，CPTAC(非TCGA)

②蛋白相关性分析

1，数据整理

2，蛋白相关性分析

PCAS在线分析

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蛋白数据下载

CPTAC蛋白组学数据库介绍及数据下载分析 – 王进的个人网站 (jingege.wang)

①蛋白数据下载

可以下载泛癌蛋白数据：UCSC Xena (xenabrowser.net)

1，TCGA-选择泛癌数据

dataset: protein expression - RPPA进行数据下载

https://tcga-pancan-atlas-hub.s3.us-east-1.amazonaws.com/download/TCGA-RPPA-pancan-clean.xena.gz; Full metadata

蛋白数据为标准化后的数据，存在负值。

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TCGA-FI-A2EY-01	TCGA-DF-A2KS-01	TCGA-A5-A1OH-01	TCGA-AX-A2H7-01	TCGA-AX-A2HA-01	TCGA-A5-A2K4-01	TCGA-EY-A2OM-01	TCGA-EY-A2ON-01	TCGA-E6-A2P8-01	TCGA-E6-A2P9-01
ACC1	2.375	0.5006	-0.2345	0.4286	-1.098	-0.6596	0.05107	-0.8085	-0.04372	-0.5503