lammps教程:Ovito中多晶不同颜色显示技巧

大家好,我是小马老师。
在前面一期推文中,介绍了多晶的建模方法,如建立Ni的多晶,代码如下:

atomsk --create fcc 3.55 Ni Ni.xsf
atomsk --polycrystal Ni.xsf polycrystal.txt final.lmp  -wrap

因为final.lmp只包含一种原子Ni,在ovito显示时不能很明显地区分晶粒。
在这里插入图片描述

常用的解决办法是使用CNA修正,如下图,白色为晶界,绿色为晶粒内部组织。
在这里插入图片描述

本文介绍另外一种更加直观的显示方式,即不同的晶粒采用不同的颜色显示,如下图所示:
在这里插入图片描述

具体操作步骤:
(1)在ovito中导入final.lmp
(2)在“Add modification”选择“color coding”,在右下方“Input property”选择“Particle Identifier”,此时,晶粒被设置为相同的颜色
在这里插入图片描述

(3)在颜色条下方点击“Adjust range”,设置不同的颜色对应不同的晶粒ID
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大功告成!

更多lammps技巧,请关注微信公众号:lammps加油站
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LAMMPS是一种基于分子动力学的高性能计算软件,可以用于模拟物质的原子和分子行为。在LAMMPS,可以使用多晶拉伸模拟来研究材料的力学性质,比如弹性模量、屈服强度、断裂韧性等。下面是关于LAMMPS梯度多晶拉伸的一些简要介绍: 1. 多晶拉伸模拟:多晶拉伸模拟是指在拉伸方向上施加一个应力,使晶体在这个方向上发生形变。在LAMMPS,可以通过施加一定的位移或应力来实现多晶拉伸模拟。 2. 梯度多晶拉伸模拟:梯度多晶拉伸模拟是指在不同位置施加不同的应力,使晶体在拉伸方向上形成梯度结构。这种模拟可以用于研究材料的局部力学性质,比如位错活动、裂纹扩展等。 3. 实现方法:在LAMMPS,可以使用fix deform命令来实现多晶拉伸模拟,使用variable命令来定义应力或位移的变化规律。在梯度多晶拉伸模拟,需要定义一个变化的应力或位移场,可以使用Python脚本或其他程序来生成这个场。 4. 结果分析:在模拟结束后,可以使用compute命令来计算材料的应力应变曲线,从获取材料的力学性质。同时,还可以使用dump命令来输出原子的位置和速度信息,用于进一步分析位错、裂纹等局部结构的形成和演化过程。 需要注意的是,在进行多晶拉伸模拟前,需要对材料进行准备,包括立晶体模型、设定原子的力场参数、进行能量最小化等步骤。同时,还需要选择合适的时间步长、温度等参数,以保证模拟的准确性和可靠性。

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