“ghost atoms”默认设置导致MDPD无法计算,添加一句命令轻松解决

大家好,我是小马老师。
使用lammps运行多体耗散粒子动力学(MDPD)时提示了一个错误:
在这里插入图片描述

在解决这个问题之前,先说说lammps中的一个概念:ghost atoms。
在lammps进行并行计算时,体系的原子会被分配到不同的cpu核心进行计算。
当一个cpu的原子A的近邻原子B处于另外一个cpu核心时,B称为A的“ghost atoms”。
“ghost”粒子保存在一个单独的列表list中,默认情况下,这个列表只保存ghost原子坐标,并不保存速度等信息。
但mpdp在进行计算时,需要ghost粒子的平移速度、角速度和角动量等速度信息。
因此,需要改变lammps默认设置,在list列表中保存ghost粒子的速度信息。
使用的命令为:

comm_modify vel yes

在in文件势函数代码之前添加这句命令后,程序就可以正常运行了:
在这里插入图片描述
lammps in文件编写相对复杂,如果在lammps模拟过程中遇到问题,可以在文章后面留言,也可以加QQ群或者微信联系我,在模拟过程中如果感觉有困难,可以报名参加一对一的咨询和指导,由我来帮你快速解决问题。

正式推出一对一咨询辅导服务,根据课题方向不同详细讲解对应的in文件编写方法、模拟关键技术、数据后处理,经一对一咨询辅导后能够独立编写出in文件。

具体内容可查看公众号一对一培训说明:lammps 一对一培训

免费试听:Cu融化模拟代码编写及启动运算方法

公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:754749935
在这里插入图片描述

扫描关注微信公众号:lammps加油站。
在这里插入图片描述

  • 2
    点赞
  • 4
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

lammps加油站

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值