“atoms are time integrated more than once”积分重复警告，常见三种原因及解决办法

大家好，我是小马老师。
本文介绍lammps in文件编写过程中一个常见的错误：重复积分。
分子动力学模拟的主要运算是原子的积分运算，通过求解积分方程得到原子的受力以及计算原子的速度，从而得出下一时刻原子的位置和状态。
原子的积分体现到代码中就是fix nve/nvt/npt等系综的设置，有些fix命令也自带积分运算，如fix move等命令。
原子不设置系综，就不会参与积分方程的求解，最明显的现象是在模拟过程中，原子是静止的。
但原子也不能设置多个系综，如果设置两个以上的系综，要参与两次积分运算，很明显是错误的。
此时，lammps会给出多重积分设置警告：

常见重复积分设置错误有以下几种：
（1）分层设置系综
有牛顿层、固定层、恒温层等不同层的模拟体系中，分层系综设置不当，容易造成积分设置重复。
如：

fix 1 all nve
fix