lammps教程:TIP5P水分子模拟

文章介绍了TIP5P水分子模型,它是基于TIP3P的改进版,更接近四面体结构。在lammps模拟中,使用刚体命令确保结构稳定,无需键角参数。通过TIP5P模型可以研究不同条件下的水行为,如温度、压力和溶质浓度的影响。
摘要由CSDN通过智能技术生成

大家好,我是小马老师。

在lammps模拟中,常见的水分子结构为SPC/E、TIP3P和TIP4P,本文介绍另外一种水分子结构:TIP5P。

TIP5P水分子是在TIP3P模型基础上添加了两个额外的虚原子L,通常这两个虚原子质量忽略不计,其中氧原子的电荷被放置在这两个虚原子L上。

L与氧原子保持固定的距离,与TIP4P模型相比,TIP5P水分子更接近"四面体"。

TIP5P水分子结构如下图所示:
在这里插入图片描述

在模拟过程中,需要使用刚体命令来保证TIP5P水分子结构的稳定性,因此,在TIP5P分子模板中,不需要设置键角参数,仅需给出5个原子的坐标即可。
(1)TIP5P分子模板
下面是TIP5P分子模板代码,模板中一共有5个原子,3种原子类型。

# Water molecule. Explicit TIP5P geometry for use with fix rigid

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

lammps加油站

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值