picrust软件安装_圈圈Bio_新浪博客

最新推荐文章于 2022-06-12 11:04:56 发布

quan575

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文章标签： python linux ubuntu docker centos

本文链接：https://blog.csdn.net/luo617/article/details/109657521

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根据16s预测功能，

Ubuntu安装picrust

#参考：http://picrust.github.io/picrust/install.html#install

##准备环境
pip install numpy==1.5.1
##后面用到h5py
sudo apt-get install libhdf5-dev
sudo apt-get install python-h5py

##如果运行脚本遇到numpy相关的问题，更新几个相关的库
pip install --upgrade numpy scipy pandas


##下载解压
wget https://github.com/picrust/picrust/releases/download/1.1.0/picrust-1.1.0.tar.gz
tar -xzf picrust-1.1.0.tar.gz
cd picrust-1.1.0

#下载好的 **16S拷贝数** 及ko文件放在picrust/data文件夹
##安装
sudo python setup.py install