DNA测序(基因组测序)与RNA测序

1、DNA测序,基因组测序,即整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行。

内容摘录自

经典:基因组测序数据从头拼接或组装算法的原理_wangchuang2017的博客-CSDN博客_基因测序算法

基因组组装

首先基因组测序产生reads,然后对reads进行组装产生长片段Contigs,再确定Contig的方向和顺序,组装产生更长的片段Scaffolds,最后再组装连接Scaffold得到完整的染色体序列。

2、RNA测序也就是所谓的RNA-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本.只有基因组中被转录出来的那部分能测到.通常用于寻找差异表达基因

可参考

RNA-seq数据分析 00:专栏内容介绍及导航 - 知乎

RNA-seq数据构成原理_生信爱好者的博客-CSDN博客_rna-seq测序原理

【基因组组装与转录本组装异同】

知识中心 - 北京概普生物科技有限公司(GapTech)

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