blast软件安装
从NCBI下载安装包https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/。下载2.16.0 linux版本,下载并解压,解压之后BLAST就安装好了。用户需要设置环境变量,目的是为了告诉系统在哪里可以找到安装好的BLAST软件。
wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz
wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz.md5
md5sum -c ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz.md5
tar -zxvf ncbi-blast-2.16.0+-x64-linux.tar.gz
#加入到环境变量
export PATH=$PATH:$PWD/ncbi-blast-2.16.0+/bin
nt/nr fasta下载
从NCBI(