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AlphaFold的横空出世,引起了生物学界的巨大震动,乃至颠覆了整个生命科学,AI可以预测蛋白结构,这种似乎是梦中的事情,竟成为现实,一时间,无论是积极的还是负面的消息,都将AlphaFold推向了舆论的浪尖。但对于我们这些生命科学领域的参与者来说,通过AI软件即可获取一个相对精确的蛋白结构,是一件非常美妙的事情。因此,今天我们将为大家详细介绍究竟该如何利用AlphaFold在线版来为我们的科研工作服务。
01 登录AlphaFold Colab网站
Google colab是一个Jupyter 笔记本环境,可让操作者在云端进行无门槛运行,免费使用Google的GPU。而AlphaFold Colab网站,可以让你使用略微简化的AlphaFold v2.3.0版本来轻松预测蛋白质的结构。当然,与本地的AlphaFold相比,这个在线的笔记本可能在预测过程中存在一定的精度下降,虽然在许多目标上的准确度与完整的AlphaFold系统几乎相同。要登录该网站,你必须使用科学上网(VPN),并下载谷歌浏览器,用谷歌浏览器完成后续的登录和操作。网址如下:
https://colab.research.google.com/github/deepmind/alphafold/blob/main/notebooks/AlphaFold.ipynb
02 注册并登录谷歌账户
进入该Colab笔记本后的界面如下所示,此时需要点击右上角红圈所示处登录谷歌账户。

如果你没有谷歌账户,需要点击“创建账号”进行注册。

按要求填写信息,完成后点击