alphafold在线预测蛋白保姆式教程

alphafold在线预测蛋白

colab 提供了一个网页接口可以调用alphafold预测蛋白结构

前提条件：

自己能访问到外网，并且有谷歌账号

1、访问下面地址：
https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/AlphaFold2.ipynb

2、在query_sequence中输入自己的蛋白序列。

测单个蛋白序列直接输入就行，多个蛋白序列需要用:来连接

比如我的是这2个蛋白序列：

erIN：
MSDFDENFIEMTSYWAPPSSPSPRTILAMLEQTDNGLNPISEIFPQESLPRDHTDQSG
AGL88：
MVKKSKGRQKIEMVKMKNESNLQVTFSKRRSGLFKKASELCTLCGAEVAIVVFSPGR

测2个蛋白,输入内容就是这样的，用:来连接！！！！》

MSDFDENFIEMTSYWAPPSSPSPRTILAMLEQTDNGLNPISEIFPQESLPRDHTDQSG:MVKKSKGRQKIEMVKMKNESNLQVTFSKRRSGLFKKASELCTLCGAEVAIVVFSPGR

3、然后点击运行->全部运行，大约30min-1hour可以完成计算，会显示自己的序列图

4、最后最后会自己下载压缩文件给你。