AlphaFold2在线预测蛋白保姆式教程

AlphaFold2在线预测蛋白

colab 提供了一个网页接口可以调用alphafold预测蛋白结构

前提条件：

自己能访问到外网，并且有谷歌账号

1、访问下面地址：

https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/AlphaFold2.ipynb

2、在query_sequence中输入自己的蛋白序列。

测单个蛋白序列直接输入就行，多个蛋白序列需要用冒号（:）来连接。

比如我的是这2个蛋白序列：

erIN：

MSDFDENFIEMTSYWAPPSSPSPRTILAMLEQTDNGLNPISEIFPQESLPRDHTDQSG

AGL88：

MVKKSKGRQKIEMVKMKNESNLQVTFSKRRSGLFKKASELCTLCGAEVAIVVFSPGR

在query_sequence中 输入内容就是这样的:

MSDFDENFIEMTSYWAPPSSPSPRTILAMLEQTDNGLNPISEIFPQESLPRDHTDQSG:MVKKSKGRQKIEMVKMKNESNLQVTFSKRRSGLFKKASELCTLCGAEVAIVVFSPGR

注：erIN和AGL88 用冒号:来连接！！！！

3、然后点击运行->全部运行，大约30min-1hour可以完成计算，会显示自己的序列图

4、最后最后会自己下载压缩文件给你。

今天的分享就到这里了。有收获的小伙伴，记得点赞、收藏、分享哦！

如果您对本次分享的内容感兴趣的话，记得关注关注哦！不然下次找不到喽！
关注不迷路哦！

“好记性不如烂笔头”，IT小本本 —— 记录IT知识，分享打工人真实的日常操作笔记！！！
😝有需要的小伙伴，可以V扫描下方二维码免费关注哦！