基因ID转换

1. 从gff或者gtf文件中获取基因的ID与symbol对应关系，以及biotype类型

应用：ID与symbol转换本地化，不依赖于第三方工具和软件包，并可以根据biotype类型区分mRNA，lncRNA以及miRNA等信息。

/home/t_rna/database/GRCh38.104/Homo_sapiens.GRCh38.104.chr.gtf.gz
# 从gff或者gft文件中获取ID与symbol对应关系，以及biotype类型
zless -S Homo_sapiens.GRCh38.104.chr.gtf.gz  |awk -F'\t' '{if($3=="gene"){print$9}}' |awk -F';' '{print$1,$3,$5}' |awk '{print$2"\t"$4"\t"$6}' |sed 's/"//g' |grep 'protein_coding' >protein_coding_id2name.xls