导语:又是一周打工人的开局,小编又来啦,来兑现上一专题说的BSA定位后的缩小候选区间&相关实验内容整理哟~
缩小候选区间的方法总结如下:
☑ 与遗传图谱结果相结合,基于表型数据,进行QTL定位,与BSA结果相结合;
☑ 开发SNP或者InDel分子标记,通过大群体性状与分子标记的共分离缩小候选区间;
☑ 结合RNA-seq结果,选取具有显著差异表达的或某显著富集通路上的基因作为候选基因。
☑ 结合相关性状的文献报告,基于序列同源、基因的功能或者相关突变类型(如EMS),锁定候选基因;
后续验证方法总结有:
☑ 将候选标记转化为CAPs(dCAPs)、凝胶电泳或者一代测序进行验证;
☑ 基于RNA-seq的差异表达分析,看基因是否有显著表达差异;
☑ 转基因验证基因功能,如基因敲除,过表达、RNAi等;
☑ RT-PCR验证候选基因的表达模式。
☑ 蛋白质水平检测基因表达:选择相应的组织以WB等检测目的蛋白的表达。
先来一个科研人员关心的内容吧—看看BSA具体发表的文章,看到这么多IF,是不是眼馋的很,原来BSA小可爱也能发大文章。下面我们一起捋捋,借鉴借鉴吧,也许下个高分文章就是你!
学习高分文章研究思路—做到开题心中有数:
1、如果你的传统定位实验由于标