如何入门生信Linux

生物信息的学习离不开Linux系统，不管自己写命令处理数据，还是使用现有的工具。Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能，可以快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。事实上在日常生信分析中，多数整理工作也都是用Linux命令的组合完成的，相比于写完整的Python或Perl程序更简便快捷；另外，生信分析用到的工具大都只在Linux下运行，而Linux发行版众多，更新速度不一，软件的安装是一个令人头大的事情。

但对我们大部分朋友来说，接触电脑一直都是图形界面系统，通过单击、双击打开文件、切换目录、安装运行软件都已经运用的得心应手，对文件路径的概念也不太关注。乍一接触Linux，会对其组织逻辑不适应，生信宝典公众号最开始推出Linux教程就是关于文件和目录的描述，以及与Windows系统的对应，方便做一个快速切换。

随后结合几年的学习和分析，从常用的Linux生信分析命令出发，精简了一批入门命令，常见错误，快捷操作，进阶操作等，涵盖了下图的很多内容。

但作为基础内容，可以入门Linux，距离生信应用还有些距离，故于2018年3月24日在北京鼓楼推出生信Linux研讨活动，希望能把Linux在生信中的应用进一步推广。

本次Linux研讨致力于从最基础出发，理论与实践结合，带你进入Linux系统的思维。这次培训将会让你对Linux系统的组织方式有合理的认识，学会生信中最常用的Linux命令及其组合操作和不同的批量操作方式，并应用于生物相关的数据处理；详细讲述Linux下常用软件安装的逻辑、方式、使用和遇到问题的解决方法；讲述Linux下流程的搭建和并行处理。

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如果想自学，请参照如下自学目录：

• Linux-总目录
• Linux-文件和目录
• Linux-文件操作
• Linux文件内容操作
• Linux-环境变量和可执行属性
• Linux - 管道、标准输入输出
• Linux - 命令运行监测和软件安装
• Linux-常见错误和快捷操作
• Linux-文件列太多，很难识别想要的信息在哪列；别焦急，看这里。
• Linux-文件排序和FASTA文件操作
• Linux-应用Docker安装软件
• Linux服务器数据定期同步和备份方式
• VIM的强大文本处理方法
• Linux - Conda软件安装方法
• 查看服务器配置信息
• Linux - SED操作，awk的姊妹篇
• Linux - 常用和不太常用的实用awk命令
• Bash概论 - Linux系列教程补充篇