py-mmcif 提取修饰氨基酸

pdbx_struct_mod_residue 对象在 mmCIF 文件中包含了与修饰氨基酸相关的信息。该对象存储了哪些氨基酸在 PDB 结构中被修饰了，通常用于描述化学修饰或通过 X 射线晶体学解析到的非标准氨基酸残基。

pdbx_struct_mod_residue 对象的典型字段：

• label_asym_id: 链标识符（chain ID）。
• label_seq_id: 序列中的氨基酸编号（seq ID），指示在哪个位置有修饰。
• auth_asym_id: 原始 PDB 文件中的链标识符（auth chain ID）。
• auth_seq_id: 原始 PDB 文件中的氨基酸编号（auth seq ID）。
• parent_comp_id: 原始氨基酸的三字母代码（未修饰的标准氨基酸）。
• label_comp_id: 修饰后的氨基酸的三字母代码（修饰后的化学名称）。

提取修饰氨基酸的示例代码：

from mmcif.io.PdbxReader import PdbxReader
import gzip

# 打开 mmCIF 文件
cif_file_path = '/path/to/your/cif/file.cif.gz'
data = []
with gzip.open(cif_file