单细胞聚类后的所有cluster差异分析

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单细胞聚类后的所有cluster差异分析

软件下载使用

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools,欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图,该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上,分析次数没有限制,可以无限使用,让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。
我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库 中,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。
软件下载官方网址: https://github.com/zihaoxingstudy1/OmicsTools ,大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

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参数解释

nested_function:是否嵌套函数

run_file_path:使用聚类完成的seurat对象rds文件

run_read_file:是否要读取文件

run_add__res__dir:是否要新建一个res_dir存储结果文件

run_add_save_file_prefix:是否要添加结果保存文件的前缀

提交

已给定的参数默认值

nested_function: TRUE ;

run_file_path: D:/omics_tools/demo_data/res_dir/renal_cancer/GSE159115/5.cluster_cell/step5_cluster_cell_scRNAseq_groups_umap_tsne.rds ;

run_read_file: FALSE ;

run_add__res__dir: FALSE ;

run_add_save_file_prefix: FALSE

窗口截图

4ddd11e977397af7db8b258fd35f1916.jpeg

执行中的显示信息

执行中,请稍后, 运行结果保存的目录位置为: D:/omics_tools/demo_data/res_dir/renal_cancer/GSE159115/5.cluster_cell; 分析结果日志保存的路径为: D:/omics_tools/demo_data/res_dir/renal_cancer/GSE159115/5.cluster_cell\step5_cluster_cell_scRNAseq_groups_umap_tsne_last_final_run_res_log.csv

执行完成的显示信息

执行已完成,运行结果保存的目录位置为: D:/omics_tools/demo_data/res_dir/renal_cancer/GSE159115/5.cluster_cell; 分析结果日志保存的路径为: D:/omics_tools/demo_data/res_dir/renal_cancer/GSE159115/5.cluster_cell\step5_cluster_cell_scRNAseq_groups_umap_tsne_last_final_run_res_log.cs

结果展示

结果文件列表

431175c7f0a2f165b6f1551c23a7c6d9.jpeg


1a47c7d14fb6c37cd987ca892896047d.jpeg

结果图

d511d35002c367989de72c7edde9d531.jpeg200fe3fd7420ae0c06e8d0905dd4bfca.jpeg41853e4f43da5000004d38ed44a92f9f.jpeg

详细的视频教学教程讲解和运行参数及结果解读见下方的b站教学视频:

https://www.bilibili.com/video/BV1oH4y1T7MG/

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邢博士谈科教

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