Py之PyTables：PyTables的简介、安装、使用方法详细攻略

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分类专栏： Python_Libraries 文章标签： python PyTables

于 2018-04-14 18:30:45 首次发布

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Py之PyTables：PyTables的简介、安装、使用方法详细攻略

1、创建、写入和读取 HDF5 文件，以及操作其中的数据

PyTables的简介

PyTables 是一个 Python 的库，用于处理大型数据集的高性能数据存储和查询。它建立在 HDF5 文件格式之上，提供了高效的数据压缩、索引和查询功能，适用于科学计算、数据分析和机器学习等领域。
PyTables 提供了两个主要的类：Table 和 Array。Table 类提供了类似关系型数据库表的功能，可以存储结构化数据，并支持索引和查询。Array 类用于存储多维数组数据，可以高效地进行切片和检索操作。
pytables是包管理分层数据和设计效率和容易处理非常大量的数据。你可以下载和使用它的免费pytables。你可以访问的文件，一些使用和介绍这里的例子。pytables之上的HDF5库，使用Python语言和NumPy包。它的特点是一个面向对象的接口，结合性能的代码的关键部分的C扩展（使用Cython），使得它快速，使用工具的交互浏览但非常容易，过程和检索大量数据。PyTables的一个重要特征是，它优化了内存和磁盘资源，数据需要更少的空间（特别是如果在飞行中使用压缩）比其他的解决方案如关系或面向对象的数据库。

1、PyTables 的特点

高性能：PyTables 使用了多种优化技术，包括数据压缩、索引和缓存等，以提高数据存储和查询的性能。
支持大型数据集：PyTables 可以处理非常大的数据集，可以将数据存储在单个文件中，并且可以高效地读取和写入部分数据，而不需要加载整个数据集到内存中。
灵活性：PyTables 提供了丰富的 API，可以灵活地进行数据的存储、查询和分析。同时，它还支持多种数据类型和压缩算法，可以根据需求选择合适的存储方式。
跨平台性：PyTables 可以在多个操作系统上运行，包括 Windows、Linux 和 macOS，且与 Python 的其他科学计算库（如 NumPy、SciPy 和 Pandas）兼容性良好。

PyTables的安装

# T1、在线下载
pip install tables
pip install -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple tables
pip install -i https://mirrors.aliyun.com/pypi/simple tables --upgrade



# T2、采用whl本地安装方式
pip install tables-3.4.2-1-cp36-cp36m-win_amd64.whl

whl文件下载地址tables · PyPI

PyTables的使用方法

1、创建、写入和读取 HDF5 文件，以及操作其中的数据

创建一个新的 HDF5 文件，包含一个 Group、一个 Array 和一个 Table。向 Table 中写入数据。读取 HDF5 文件中的数据，包括 Array 和 Table 中的数据。

import tables as tb
import numpy as np

# 创建一个新的 HDF5 文件并打开
with tb.open_file('example.h5', mode='w') as f:
    # 创建一个 Group 对象
    group = f.create_group('/', 'my_group', 'Group for example')

    # 创建一个 Array 对象
    data = np.random.randn(100, 100)
    f.create_array(group, 'my_array', data, 'Example array')

    # 创建一个 Table 对象
    description = {'col1': tb.Float64Col(), 'col2': tb.StringCol(10)}
    table = f.create_table(group, 'my_table', description, 'Example table')

    # 写入数据到 Table
    for i in range(10):
        table.row['col1'] = i
        table.row['col2'] = 'row' + str(i)
        table.row.append()
    table.flush()

# 读取 HDF5 文件中的数据
with tb.open_file('example.h5', mode='r') as f:
    # 访问 Group 对象
    group = f.get_node('/my_group')

    # 访问 Array 对象
    array = f.get_node('/my_group/my_array')
    print("Array shape:", array.shape)

    # 访问 Table 对象
    table = f.get_node('/my_group/my_table')
    print("Table description:", table.description)

    # 读取 Table 中的数据
    for row in table.iterrows():
        print(row['col1'], row['col2'])