vi | 常用操作

最新推荐文章于 2024-07-20 21:08:47 发布
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分类专栏： Linux 文章标签： vim linux
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版权
  1. 编辑模式
    1.1
    :%s/str1/str2/g
    替换每一行中的str1为str2
    例： :%s/scaffold/chr/g
    将文本中所有的字符串“scafflod”替换为“chr”
    1.2
    :1,9d
    删除第1-9行
  2. 命令模式
    2.1
    d$：将光标所在位置之后的内容删除（仅限该行）
name_qgy
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如何获得基因名与基因类型的对应关系——下载GTF文件 基因注释
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level1代表可靠的注释信息，有直接的实验证据支持的注释信息；level2代表的是经过人工校对的注释信息，取HAVANA和Ensembl注释信息中一致的注释信息；level3指的是软件注释的信息，通常是Ensemble中和HAVANA不一致的注释信息。对于人和小鼠而言，NCBI, Ensembl等数据库都保存了对应的基因注释信息，不同数据库中的信息来源和可信度都不一样，gencode综合HAVANA和Ensembl 数据库中的信息，通过实验手段加以验证，从而构建一个高质量的注释信息数据库。
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