03 如何理解atac-seq中的peak

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如何理解atac-seq中的peak

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ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种用于研究基因组开放性的技术。在ATAC-seq分析中，peak指的是某些区域的DNA开放性显著高于其他区域。通常，这些开放的区域在基因组上形成峰，因此称为peak。

这些开放的区域通常对应着活动的基因的启动子和转录因子结合位点，以及细胞调控因子的结合位点。因此，研究ATAC-seq中的peak可以提供有关细胞内基因表达和调控的信息。

简单地说，在ATAC-seq中，peak代表着基因组中的开放性增强区域，这些区域可以用于揭示基因的活动和调控。