ART是一款比较流行的模拟数据软件。可以模拟生成三大二代测序平台Illumina's Solexa, Roche's 454和Applied Biosystems' SOLiD的single-end, paired-end/mate-pair reads,同时也可以对序列比对、无参组装、call SNP等进行打分,可以说是功能相当全面。
ART原始生成的是测序数据fastq文件。而且只能用一个物种的基因组做为输入。
,art生成的fastq文件是模拟测序生成的序列?那那些所谓的quality score是什么?也就是说,比如我用一个大肠杆菌的基因作为输入,art生成的fastq文件里面所有序列都是合格的大肠杆菌序列吗?然后我想要细菌病毒序列各50%的fastq或者fasta文件,应该用什么呢?