KEGG 下载 Pathway 通路数据

• 进入KEGG物种列表，网址：https://www.kegg.jp/kegg/catalog/org_list.html

• 这里以小鼠为例，点击Ctrl+F查找物种小鼠的拉丁名Mus musculus

  这里也可以用mouse来搜索，不过可以看到在kegg中含有三种鼠的信息。为了信息准确，最好使用拉丁名作为搜索条件。

  

• 点击Brite hierarchy

  

• 进入KEGG Orthology (KO)

  

• KEGG Orthology 提供了两种可供下载的格式，比如下载htext格式

  如果提示连接不到网络，可以多次点击，国外网的原因。。。

  

• htext格式如下

  

• 下载json格式

  

• json格式如下，这种格式更适合提取数据