2019/0901_motifs

motif是在许多蛋白质分子中,由几个具有二级结构的肽段在空间上相互接近、相互作用,所形成的折叠模样称为超二级结构,又称为模体。锌指结构是一种常见的模体。

motif在生物学中是一个基于数据的数学统计模型,典型的是一段sequence也可以是一个结构,是特定的group的序列预测,例如一个DNA sequence可以定义为转录因子结合位点,也就是序列倾向于被这种factor结合。

对蛋白质来说,sequence motifs可以被定义为蛋白质(蛋白质序列)属于一个给定的蛋白质家族。一个简单的motif可以是,例如,一个模式pattern,而这个模式被这个group中的所有成员共享。

例如WTRXEKXXY(这里,X代表任何氨基酸)。当然也有更复杂的motif模型。Motif有时和特定的功能联系一起。

motif在生物学上翻译成,模体,模序,基序等。

蛋白质分子中的一些二级结构单元,往往有规则地聚集在一起形成全由α-螺旋、全由β-片层或α-螺旋与β-片层混合、均有的超二级结构基本形式,具体说,形成相对稳定的αα、βββ、βαβ、β2α和αTα等超二级结构又称模体(motif)或模序.

 

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