使用Cytoscape-BiNGO 对非模式生物做go富集

最新推荐文章于 2024-06-18 21:30:00 发布
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分类专栏： BI 文章标签： golang
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本文链接：https://blog.csdn.net/uqyuan0515/article/details/120404037
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与模式生物不同的是，分析非模式生物时需要自己创建annotation 信息， 可以用blast2GO 或者 InterProSan得到。

 最终输入到BiNGO的表格格式如下：

(species=Custom_species)(type=Biological Process)(curator=GO)
gene1=0001000
gene2=0000222
gene3=1234567
gene4=7654321

tips: 第一行不能省，不然会报错。

        没有GO:, 直接是7位go id. 

uqyuan0515
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