RNAseq理论基础

最新推荐文章于 2024-03-13 21:48:54 发布
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计算机科班出身，做生物学分析难免对概念理解有些吃力，日常主要做DBA，最近领导让我转战RNAseq分析，脚本要写，理论，肯定也要有些基础的，很多高中背的滚瓜烂熟的基础知识，全都还给老师了，好吧，度娘，请从我脑海里挖出来。。。

1、染色体（Chromosom）、DNA、基因(gene)

染色体：DNA和蛋白质组成染色质，染色质是染色体构成的基本单位，核小体（nucleosome）是构成染色质的基本单位

DNA：双链核糖核苷酸序列，可以通过转录表达蛋白质，调控生物过程

基因：有遗传效应的DNA片段，有外显子和内含子

RNA：DNA转录成RNA，包括编码RNA（可以翻译成蛋白质）和非编码RNA

2、RNA的分类

3、转录组(transciptom)、转录本(transcript)

转录组：特地条件下，DNA转录形成的所有mRNA、noncoding RNA、small RNA的总称

转录本：一条基因，通过转录形成一种或多种可编码蛋白质的成熟mRNA的集合

4、RNAseq测序基本流程

引用百度百科：

RNA-seq即转录组测序技术，就是把mRNA，smallRNA，and NONcoding RNA等或者其中一些，用高通量测序技术进行测序分析，反映出它们的表达水平。

下一步，就是对Illumina的测序文件进行分析，找出差异表达基因，gene fusion等

wangyiqi806643897
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