R语言利用peason相关性获取基因和细胞关系矩阵中细胞间的关系(相关系数矩阵)

 1.利用安装在服务器上jupyter notebook中的R核来执行R代码,要是已经配置好了jupyter notebook一直找不到R核,那就在jupyter notebook安装的环境中进入R环境再次进行配置,详见之前的教程:https://editor.csdn.net/md/?articleId=115184963
在这里插入图片描述

 2.导入要使用的基因和细胞关系矩阵,我这里使用的是.csv文件,所以使用read.csv()函数进行读取。
在这里插入图片描述
 3.因为R中的Peason相关性是针对列与列之间的关系,所以选取需要的列
在这里插入图片描述
 要注意的是:csv文件的列数是从1开始算的,不是从0开始算的

 4.查看一下我们读取的数据是不是符合要求
在这里插入图片描述
 查看了前7行,发现选取的列数正确,符合我们的要求,继续下一步。

 5.存储Peason相关系数矩阵在这里插入图片描述
 6.最后查看一下获得的相关系数矩阵
在这里插入图片描述
 大功告成!!!

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