1.利用安装在服务器上jupyter notebook中的R核来执行R代码,要是已经配置好了jupyter notebook一直找不到R核,那就在jupyter notebook安装的环境中进入R环境再次进行配置,详见之前的教程:https://editor.csdn.net/md/?articleId=115184963
2.导入要使用的基因和细胞关系矩阵,我这里使用的是.csv文件,所以使用read.csv()函数进行读取。
3.因为R中的Peason相关性是针对列与列之间的关系,所以选取需要的列
要注意的是:csv文件的列数是从1开始算的,不是从0开始算的
4.查看一下我们读取的数据是不是符合要求
查看了前7行,发现选取的列数正确,符合我们的要求,继续下一步。
5.存储Peason相关系数矩阵
6.最后查看一下获得的相关系数矩阵
大功告成!!!