Question 1: What is DCA?
想要理解DCA(Detrended correspondence analysis, 消除趋势对应分析),首先要理解CA(Correspondence analysis,对应分析)。就群落排序而言,对应分析比主成分分析(PCA)更好,更稳健,但是在处理长生态梯度时存在缺陷或者“错误”,这些问题可以通过消除趋势的对应分析(Detrended Correspondence Analysis, DCA)处理。由于在对应分析(Correspondence analysis,CA)中可能会产生“弓形效应(arch effect)”,对排序的精度产生影响,此时去趋势对应分析(Decentred Correspondence Analysis,DCA)也许会是一个较好的选择。
弓形效应如下图的X的点的形状。
×为消除趋势前样品排布;· 为消除趋势后样品排布
由于是为了去除CA第二轴产生的弓形效应的影响,所以其大体和CA是一致的。仅仅在求第二轴的坐标值时,不需要进行正交化,取而代之的是除趋势。即将第一轴分成数个区间,在每一区间内对第二轴的排序值分别进行中心化。用经过除趋势处理的样本的排序值,再进行加权平均求新的特征排序值。跟第一轴的求法一样,不断的迭代。采用一个将第一轴分成一系列区间,在每个区间内将平均数定为零,从而消除了弓形效应。
Qu