怎么让热图显示基因名_热图绘制

最新推荐文章于 2023-01-05 10:30:36 发布

weixin_39704246

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文章标签：怎么让热图显示基因名

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_39704246/article/details/112158008

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热图是一种常用的基因表达差异展示工具，本文探讨如何在热图中清晰地显示基因名称，提升数据解读的直观性。

摘要由CSDN通过智能技术生成

热图是表示不同基因或者蛋白表达差异量的一种方式，由于它能直观的表示相关信息，因此应用非常普遍。

数据格式：

library(pheatmap)
mydata<-read.table("gzwj1.csv",header=TRUE,sep = ",")
mydata2<-mydata[,-1]
rownames(mydata2)<-mydata[,1] 
#读取数据并将第一列数据改为行名
pheatmap(mydata2,cluster_rows = F,treeheight_row=200, cluster_cols =T,treeheight_col=30,legend = T,color = colorRampPalette(c("yellow2","greenyellow","dodgerblue"))(1000),border_color = T,fontsize=12,fontsize_row = 16,fontsize_col = 28,display_numbers = F,number_format = "%.2f" ,scale = "row")
#cluster_row=F表示不绘制行聚类线，cluster_cols=F表示不绘制列聚类线，treeheight_row表示横向聚类线的宽度，legend=F表示不绘制图例，color表示绘制图形的颜色("magenta","white","cyan")，border_color=T表示绘制边缘颜色，fontsize表示图例大小，fontsize_row=12表示行名字母大小，fontsize_col表示列名字母大小，display_numbers表示是否显示不同基因表达量数值，number_format="%.2f"表示小数点后2位

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