一个基因如何画出好看的热图?

在科研数据分析中,我们往往是抽丝剥茧,希望找到几个,最好就是一个关键基因,比如我们想找易感基因、驱动基因、Marker基因等。当然功夫不负有心人,最终我们都可能如愿以偿!但后续如何把结果呈现出来,却不知所措了:一个基因的数据该如何可视化?可以画热图吗?

一般的情况,我们画出来的图是这样的:

1.png

图1 普通热图

 

 

如何完善上面的图呢?首先我想到的两个思路是:1. 把热图掰弯变成环形热图;2. 调整热图的图例及比例构成。那么如何实现呢?接下来我们可以通过“派森诺基因云(https://www.genescloud.cn)”的“交互原值热图”进行实现。

 

一、准备数据

准备图2, 图3 所示数据,“交互原值热图”工具支持两种类型的数据。

2.png

图2  纵向数据

3.png

图3  横向数据

 

二、提交绘图

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