blast mysql 基因序列_在生物信息学中，BLAST和BEAST的简单介绍

原标题：在生物信息学中，BLAST和BEAST的简单介绍

在生物信息学，BLAST(基本的局部比对搜索工具)是一种算法，用于比较主生物的序列信息，诸如氨基酸序列的蛋白质的或核苷酸的DNA和/或RNA序列。BLAST搜索使研究人员能够将查询序列与序列的库或数据库进行比较，并识别类似于高于特定阈值的查询序列的库序列。

根据查询序列可以获得不同类型的BLAST。例如，在发现小鼠中先前未知的基因后，科学家通常会对人类基因组进行BLAST搜索，以确定人类是否携带相似的基因; BLAST将基于序列的相似性鉴定人类基因组中与小鼠基因相似的序列。BLAST算法和程序由Stephen Altschul，Warren Gish，Webb Miller，Eugene Myers和David J. Lipman在美国国立卫生研究院设计，并发表在“分子生物学杂志”上。在1990年，引用超过75,000次。[1]

BEAST,贝叶斯进化分析采样树，是一个使用MCMC进行分子序列贝叶斯分析的跨平台程序。该程序是面向(严格和放松)分子时钟分析。它可以作为一种构建系统发生学的方法，但它也可以用来测试进化假设，而不需要在单一树的拓扑结构上设置条件。

BEAST使用MCMC对树空间进行平均，因此每棵树都与它的后验概率成正比。它使用允许用户设计和运行大量模型的XML输入格式。我们还包括一个图形应用程序，用于在各种模型下生成这种格式。返回搜狐，查看更多

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