生物版本DeepSeek | Evo 2为生物学设计带来新机遇

最新推荐文章于 2025-04-28 21:51:37 发布
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Evo 2是一个革命性的生物学基础模型，由来自Arc Institute、英伟达、斯坦福大学、加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校的科学家们，联合发布。能够处理从DNA序列预测到基因组生成等多种任务，且不依赖于特定任务的微调。通过对9.3万亿DNA碱基对的学习，Evo 2能够在基因组、RNA、蛋白质等多个层面上准确预测基因变异的影响，助力科学家加速生物学创新。

团队称，Evo 2 是迄今为止最大的公开 AI 生物学模型，完整版高达400亿参数，包含12.8万个物种的9.3万亿个核苷酸。它囊括了生物学的基本语言：DNA、RNA 和蛋白质，能够一次分析长达一百万个核苷酸的序列长度。

引言

研究背景与现状：生物学的研究范围从分子到系统，DNA序列是所有生命体传递遗传信息的基础，但基因组内容和长度在不同生物间差异巨大。原核生物的基因组较为简单，而真核生物则具有复杂的基因组结构，包含大量非编码区域、可变剪接和表观基因组控制层次。当前机器学习和深度学习模型，特别是基于基因组序列的语言模型，能够帮助揭示DNA序列

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开源项目evo2安装教程
猿小白的博客
04-03 98
Evo 2 是一种先进的 DNA 语言模型，用于长上下文建模和设计。Evo 2 使用 StripedHyena 2 架构在单核苷酸分辨率下对 DNA 序列进行建模，上下文长度可达 100 万碱基对。Evo 2 使用 Savanna 进行预训练，并在 OpenGenome2 数据集上进行自回归训练，该数据集包含来自所有生命领域的 8.8 万亿个标记。
NVIDIA 和 Arc Institute 推出生物分子科学的突破性基础模型 Evo 2
iCloudEnd的博客
02-24 85
现在，世界各地的科学家都可以使用 Evo 2，这是一种旨在推动生物分子研究的尖端基础模型。Evo 2 使用Amazon Web Services 上的 NVIDIA DGX Cloud 构建，是目前最大的公开可用的基因组数据训练 AI 模型。它是由非营利组织 Arc Institute 和斯坦福大学牵头合作开发的。Evo 2 模型可通过NVIDIA BioNeMo 平台使用，包括作为 NVIDIA NIM 微服务，为开发人员提供简化且安全的 AI 部署。
Evo2 开源项目使用教程
gitblog_00789的博客
03-29 803
Evo2 开源项目使用教程 evo2 Genome modeling and design across all domains of life 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ev/ev...
Evo 2：AI 赋予基因组设计新生命，迎接生物学新时代
cwahfma的博客
02-22 2639
2025年2月19日，由Arc Institute、英伟达、斯坦福大学、加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校的顶尖科学家联合发布了革命性生物学大模型——Evo 2。该模型不仅通过AI的强大能力深入理解基因组学的复杂性，还突破性地实现了对基因变异的精准预测与基因组序列的生成，标志着生物学研究迈向新的时代。通过结合9.3万亿个DNA碱基对的训练数据和创新的StrippedHyena 2架构，Evo 2能够提供跨物种的基因变异比较，为生命科学领域带来了前所未有的研究潜力和应用前景。
Evo2：AI生物学模型的突破性进展
人工智能讲师分享前沿技术
03-12 1152
Evo2 是由斯坦福大学、英伟达、Arc研究所、加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校的科学家联合发布的生物学大模型，其完整版包含 400亿参数，训练数据覆盖 12.8万个物种 的 9.3万亿个核苷酸。这一模型的发布标志着AI在生物学领域的重大突破，为基因组学、精准医学、药物研发和合成生物学带来了全新的可能性。传统的生物学研究依赖于实验方法和数据分析，但随着基因组学的快速发展，海量的基因组数据需要更高效、更智能的工具来处理和解读。Evo2的出现，正是为了解决这一问题。
Evo 2：基因编程AI革命！！DNA版GPT-4问世：100万碱基全解析，自动设计基因编辑器
士多啤梨先生の博客
02-23 927
Evo 2 是一款由 Acr 研究所、英伟达和斯坦福大学联合开发的 DNA 语言模型，可处理长达百万碱基对的序列，支持基因组设计、变异预测及合成生物学研究。
EVO工具常用指令
weixin_46039239的博客
06-14 958
EVO工具常用指令 参考教程 1.CSDN. https://blog.csdn.net/gyhjlauy/article/details/100598260/ 2.Github的EVO官方. https://github.com/MichaelGrupp/evo 如何显示和更改可用参数： LINK. https://github.com/MichaelGrupp/evo/wiki/Configuration 轨迹图对比 evo_traj tum orbslam2.txt plslam.txt --ref
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用于 MacBook SSD 升级的 Samsung_SSD_970_EVO_Plus_2B2QEXM7.iso 升级方案：官方固件>刷入U盘>重启电脑选择U盘启动，根据提示刷入（一直输入“Y”回车，直到完成自动重启） 注意还得下载制作一个Rufus U盘启动：...
包含400亿个参数！迄今最大开源生物学AI模型Evo 2发布，可设计涵盖生命所有领域的遗传密码
悟道西方
04-02 110
近日，美国Arc研究所与NVIDIA公司、斯坦福大学和加州大学伯克利分校等机构合作，发布了迄今为止最大的公开可用生物学AI模型Evo 2，有望彻底改变人们对生命遗传信息的理解和应用。与仅关注原核基因组的Evo相比，Evo 2纳入了来自人类、植物以及真核生物域中其他更复杂的单细胞和多细胞物种信息，实现了前所未有的跨物种泛化，并显著拓宽了其应用范围。该模型能够将微小的序列变化与系统级和有机体级的影响联系起来，弥合分子生物学与进化基因组学之间的差距，是基因组研究领域的一个突破性里程碑。：1.线粒体基因组；
SLAM测评工具evo安装
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在网上看到有关evo安装，主要有两种方式，一种是快速安装，另一种是源码安装。但无论哪种安装方式，都需要先更新一下pip。
深度学习--自然语言处理统计语言与神经语言模型
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04-25 1573
传统的语言模型是基于词袋模型（Bag-of-Words）和one-hot编码展开工作的，即在传统的语言模型中要生成一个句子，其实是拿一堆词语进行拼凑，拼凑出一个句子后我们需要有一个评委来对这个机器生成的句子进行打分和评价，语言模型就是这么一位评委，它会给每个句子打出一个概率值，以表明他们与人类语言的接近程度。
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现代深度学习中出现了多种归一化技术，它们各有针对的应用场景和特点。我们下面将介绍批归一化（Batch Normalization）层归一化（Layer Normalization）组归一化（Group Normalization）等最为常见的方法，以及实例归一化（Instance Normalization）、**权重归一化（Weight Normalization）**等衍生技术。对于每种方法，我们将讨论其核心原理、计算步骤、优势与局限。
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weixin_53707653的博客
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在我们的网络中，输出图像的大小为(224,224)，下采样率为32，使我们的蒙版大小为(7,7).我们进一步使用从预训练模块中学到的特征图进行分类研究。此外，与传统的 CNN 相比，ViT 在图像处理中表现出较少的定位能力，因为它们的机制主要针对图像的块级，而不是直接关注单个像素。].我们在 CNN 中观察到的优势，以及预训练对自我监督学习的显着好处，以及 ViT 的潜在缺点，都激发了进一步的思考：是否有可能将性能良好的 CNN 与 BERT 风格的生成式自我监督学习相结合进行预训练，以结合两者的优势？
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