KEGG被称为京都基因组百科全书,是一个综合性的数据库。对于如此庞大的数据库,肯定需要对数据进行分门别类的整理。除了将各种数据拆分到不同的子数据库中之外,KEGG还对所有的数据进行了更加细致的功能分类,这些功能分类的信息就存储在brite 数据库中。
birte 主要包含以下五大类别的分类信息:
genes and protein
compounds and reactions
drugs
diseases
organisms and cells
在brite数据库中,以文件的形式存储分类信息。包含两种格式的文件:
table 格式,比如对药物的分类
http://www.genome.jp/kegg/drug/br08340.html
htext 文件,比如kegg orthology 的分类
http://www.kegg.jp/kegg-bin/get_htext?ko00000.keg
提供了两种格式的文件用于下载,htext
对应的后缀为 keg&