使用SOAPfuse进行融合基因的分析

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SOAPfuse是华大开发的一款，专门针对human的融合基因进行分析的工具，项目链接如下

http://soap.genomics.org.cn/soapfuse.html

在对应的文献中，将该工具与其他几款软件进行了比较

从图中可以看出，SOAPfuse运行时间快，内存消耗小，敏感性好。在我看来，内存消耗做的是真的不错，其他两点的话因为参考数据的不同，不太有参考价值。

sourceforge上保存了最新版的soapfuse, 直接下载解压即可。

wget https://sourceforge.net/projects/soapfuse/files/SOAPfuse_Package/SOAPfuse-v1.27.tar.gz
tar xzvf SOAPfuse-v1.27.tar.gz

在运行SOAPfuse之前，需要准备以下几个文件

1. reference database

和其他软件类似，SOAPfuse也需要建立物种对应的数据库，在软件安装的source目录下，提供了建立数据库的脚本，用法如下

perl SOAPfuse-S00-Generate_SOAPfuse_database.pl \
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