circos 可视化手册-ticks 篇

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!

在circos中，通过ticks block来添加刻度线。刻度线和我们的比例尺是一样的，需要有一个最小单位。

通过chromosomes_units定义最小单位，用法如下

chromosomes_units  = 1000000

之后的刻度线都基于该最小单位进行定义。对于刻度线，有两个全局参数控制其显示方式

1. show_ticks
   show_ticks = yes 表示显示刻度线

2. show_tick_labels
   show_tick_labels = yes 表示显示刻度线上的标签

对于刻度线而言，可以由多个不同标准的刻度组成，和厘米，毫米的概念差不多，可以每5M标记一个刻度线，也可以每10M标记一个刻度线。对于每一种规格的刻度线，通过tick 这个block 定义。看下面这个例子

首先是两个全局参数，表明显示刻度线。接下来就是ticks模块。上图中的ticks 由两个tick构成。

关于刻度线的相关参数，可以分成一下两大类别

1. 刻度线的显示

1. radius<