使用Aspera下载NCBI和ENA数据库中的数据

使用Aspera下载NCBI和ENA数据库中的数据

①NCBI数据库储存的常用数据有：Nt库，Nr库，Swissprot库，以及物种的基因组数据（Genome数据库）等。
ENA数据库储存的常用数据有：SRR数据库数据，pfam等。

②NCBI数据库
NCBI，全称National Center for Biotechnology Information。官网：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
下载数据地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/
使用anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/FASTA/nr.gz 这样的格式

③ENA数据库
ENA，全称European Nucleotide Archive。官网：https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
下载数据地址：http://ftp.ebi.ac.uk/或者http://ftp.sra.ebi.ac.uk/
官方下载方法介绍地址：https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/retrieval/file-download.html#
有9种。分别是：①Using ENA Browser②Using ENA File Downloader Command Line Tool③Using ENA FTP Downloader GUI tool④Using Globus⑤Using enaBrowserTools⑥Using wget⑦Using FTP Client⑧Using Aspera⑦Common Issues

如果是SRR数据，使用era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR885/002/SRR8858432/SRR8858432_subreads.fastq.gz
如果是pub/databases下数据，使用fasp-ebi@fasp.ebi.ac.uk:databases/Pfam/current_release/Pfam-A.hmm.gz
fasp-ebi@fasp.ebi.ac.uk:software/unix/iprscan/5/5.52-86.0/interproscan-5.52-86.0-64-bit.tar.gz
注：pub目录下的所有文件都不出现pub目录，直接从下级目录下载

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