作者,追风少年i~
高考第二天,去看了一下在今天高考的数学卷子,惊奇的发现最后的压轴题自己还会做,😄 ,大家不妨试一试,题在下面
以前学数学的时候总是觉得生活中根本用不到,买菜根本不用计算log,就算做了数学老师,好像也就停留在纸面上,到底有什么用,想象不到~~~
时至今日做了生物信息,才发现当初的自己井底之蛙,单细胞空间数据处理运用到了庞大的数学知识,什么各种检验,均一化、标准化、降维、聚类等等等等,只可惜早已不是18岁的自己,如果当时能意识到这些方面,自己应该不会30岁买不起房吧~~~😄😄
今天分享一个小知识,关于空间注释的问题,主要分为两个流派,
流派1、依赖单细胞作为ref的注释
这个其实最常见,但是问题相当明显,单细胞必须匹配空间数据,一般很难有这样理想的结果,优点也特别明显,可以很精确的注释空间细胞位置。这类方法非常多,大家可以参考文章
超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结
10X单细胞空间联合分析方法论
10X单细胞空间联合分析之单细胞数据不匹配的处理情况
10X空间转录组数据分析梳理
10X单细胞空间联合分析方法汇总及算法总结
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我写了很多,但这个不是今天的重点,今天的重点是流派2
流派2 区域划分与基因特征,如下图
流派2 才是我认为最好的空间注释方法,但是呢,需要强大的生物学背景,如果大家想做一名科研人员,或者跟我一样想好好做数据分析的工作,就要好好锤炼了。这个流派涉及到很多的方法内容,以后我会逐步与大家分享,如果大家的空间数据没有合适的单细胞匹配,不如就学一学流派2 ,通常会收获很好的效果。
生活很好,有你更好