空间转录组共定位展示分析图

本文由 Evil Genius 介绍空间转录组中细胞和配受体的共定位展示方法,包括细胞类型空间定位图、方向图、密度分布图等,并通过10X空间转录组数据,详细阐述如何绘制共定位趋势图,强调了选择共定位效果强的配对以提升绘图质量的重要性。
摘要由CSDN通过智能技术生成
作者,Evil Genius
关于空间共定位(细胞和配受体)的展示方式已经提供了好几种了,列在下面,供大家参考
空间转录组细胞类型和配受体的空间定位图
空间细胞类型方向图
空间细胞类型密度分布图
空间转录组数据分析之近邻热图绘制
10X空间转录组绘图分析之体现两种细胞类型的空间位置
10X空间转录组时空基因细胞动态(共定位)绘图
这一篇我们来展示最后一种共定位的方式,如下图

同样的做法,我们可以展示细胞类型的共定位或者配受体的共定位,右图体现了共定位的趋势,我们来实现以下,我随便选了两种细胞类型,绘图结果如下;

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