单细胞转录组数据分析的10大软件/流程

单细胞数据分析现在已经有上千个软件工具可供使用了，这为用户带来便利的同时也造成了选择困难。就像时间一样，一个表，没问题，但如果有两个表，时间还不一样，该信谁的呢？

正好我们前面一篇文章介绍了这样一个开源数据库：https://www.scrna-tools.org/，里面收集了几乎所有的单细胞数据分析工具，我们在这个网站上通过工具的引用数排序，截取前 10 行结果，得到目前引用数最多，应用最广的 10 个单细胞数据分析工具 / 流程。这无疑能为我们以后的选择提供一个参考，如果你感到迷茫，选择引用数多的大体不会有错。

1. STAR

STAR（Spliced Transcripts Alignment to a Reference）是一款用于转录组数据比对的工具，推出于2012年。STAR 在 RNA-seq  领域广泛应用，其独特的两阶段映射策略提高了比对精度，同时支持并行计算，使其适用于大规模数据处理。STAR 的高效性和准确性使其成为生物信息学研究中的重要工具，为基因表达和调控研究提供可靠支持。