R语言实践——U.Taxonstand标准化动植物科学名

简介

U.Taxonstand是近期在Plant Diversity期刊上发表的一个R语言包。用于标准化（实际上更应该是通过与国际大型数据库中的接受名进行比较）动植物科学名。本文将根据该库在github上的示例文档来实践操作一下U.Taxonstand。之后会对原始文献里的示例进行重复。

准备工作

支持包的安装：openxlsx、plyr、magrittr

install.packages("openxlsx")
install.packages("plyr")
install.packages("magrittr")

openxlsx用于读取xlsx文件。该文献中检索的数据库皆为xlsx文件。

plyr和magrittr是该文献发表的U.Taxonstand的支持包。

U.Taxonstand安装

博主使用install.packages(“U.Taxonstand”)并未安装成功。

方法1：GitHub

文中提及：U.Taxonstand可在GitHub上开放获取，链接如下：https://github.com/ecoinfor/U.Taxonstand
在网站上下载了zip文件后，直接安装

install.packages("D:/ALL_Softwares/R-4.2.0/U.Taxonstand-main.zip")

博主这里仍是安装失败。因为不擅长使用R，所以使用了第2种方法

方法2：devtools

另外，也可通过devtools包的install_github函数安装，操作如下：

> library("usethis")
> library("devtools")
> install_github("ecoinfor/U.Taxonstand")