Cell Research：华农解析水虻基因组图谱和肠道微生物组降解规律

近日，华中农业大学生命科学技术学院张吉斌教授课题组与上海植物生理研究所黄勇平研究员课题组合作，对武汉亮斑扁角水虻纯化10代的品系进行了全基因组测序，获得了高质量水虻基因组图谱，并对水虻转化不同有机废弃物的肠道微生物组进行分析，揭示了水虻能在畜禽粪污等恶劣环境中高效利用有机废弃的机制。

研究结果于2019年11月25日在线发表在细胞生物学学术期刊《Cell Research》(IF=17+)上。

随着全球人口的迅速增长和餐厨剩余物、畜禽粪污等废弃物的围城，粮农组织号召全世界利用食用昆虫将有机废弃物质高效资源化，满足畜禽和人类对饲料和食物的需求，并能净化环境。水虻优良品系的开发和水虻转化有机废弃物的工业化应用成为当下研究的热点。

华中农业大学喻子牛、张吉斌教授课题组从美国德州农工大学引入水虻养殖技术，采集全国不同地区的野生水虻进行室内驯化，通过3年的努力，成功获得了具有自主知识产权的高效转化有机废弃物的亮斑扁角水虻武汉品系，并解决了水虻大规模饲养的关键技术，建立了水虻与微生物联合转化有机废弃物新工艺。

为了对水虻武汉品系进行深入的研究与开发，课题组对系野生型杂合性高的亮斑扁角水虻武汉品系进行纯化，培养出亮斑扁角水虻武汉纯化品系。

随后，张吉斌教授课题组与黄勇平研究员课题组合作，获得了高质量水虻基因组图谱，并通过对水虻转化不同有机废弃物的肠道微生物组进行分析，揭示了水虻能在畜禽粪污等恶劣环境中高效利用有机废弃的机制。

该研究进一步研发了一种基于CRISPR/Cas9基因编辑的高效方法，获得了水虻不具有飞行能力的品系，并增强了饲养能力的表型，为水虻应用基础研究、优良品系的开发和水虻转化有机废弃物的工业化应用奠定了基础。

华中农业大学蔡珉敏副教授为论文共同第一作者，张吉斌教授和中科院上海植物生理研究所黄勇平教授为共同通讯作者。本研究得到十三五国家重点研发计划、国家外专局高端外国专家项目和中国科学院的资助。

论文链接

https://www.nature.com/articles/s41422-019-0252-6

猜你喜欢

10000+：菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature Cell专刊 肠道指挥大脑

系列教程：微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能：学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂：宏基因组 寄生虫益处 进化树

必备技能：提问 搜索  Endnote

文献阅读 热心肠 SemanticScholar Geenmedical

扩增子分析：图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

在线工具：16S预测培养基 生信绘图

科研经验：云笔记  云协作 公众号

编程模板: Shell  R Perl

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流、快速解决科研困难，我们建立了“宏基因组”专业讨论群，目前己有国内外5000+ 一线科研人员加入。参与讨论，获得专业解答，欢迎分享此文至朋友圈，并扫码加主编好友带你入群，务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。PI请明示身份，另有海内外微生物相关PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助，首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路，仍未解决群内讨论，问题不私聊，帮助同行。

学习16S扩增子、宏基因组科研思路和分析实战，关注“宏基因组”

点击阅读原文，跳转最新文章目录阅读