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- 4月19-21日，北京，GEO/TCGA专题课程 - 挖掘公共数据，发表自己文章
- 5月10-12日，北京，群体和单细胞转录组专题培训
- 6月21-23日，北京，宏基因组分析技术研讨会第四期
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- 西奈山医学院房刚组招聘博后—宏基因组与表观基因组
- 林科院亚热带所袁志林组招聘博后—林木根际微生物
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一作解读
一作解读专栏，由论文第一，或共同第一作者，来亲自讲述文章结果和背后的故事。
- Microbiome：环境过滤驱动农田生态系统土壤古菌独特的空间分布
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- Microbiome：土壤微生物驱动退耕还林系统土壤剖面的养分循环
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- PC: 陈峰等纵论口腔菌群何以影响全身
- SBB：石油污染土壤微生物群落构建与生物多样性研究
- SCLS：水稻微生物组时间序列分析
- 中国微生物组计划—农作物微生物组
- 应用生态学报：东北黑土区不同纬度农田土壤真菌分子生态网络的比较
- Sciences：用膳食纤维"钓"出15株缓解糖尿病的细菌！
- EID-2017-宏基因组测序在新发腹泻病毒鉴定中的应用
文献精读
精读主要是指全文翻译，一字不落的阅读，通常字数过万
- Science：肠道菌群又添一大功能，揭示你的真实年龄
- Nature：TEDDY计划中幼儿肠道微生物组随时间的发育
- Nature: 来自细菌的通告——群体感知效应
- Nature：皮肤微生物群-宿主相互作用
- NRM：人类微生物培养及培养组学culturomics
- NRM: 蓝藻水华的形成机理及防治动态
- NRM: 拥抱未知-解析土壤微生物组的复杂性
- NRM: 追“根”溯源：植物根际的微生物生态
- NRM 关键物种对于微生物菌群结构和功能的驱动作用
- NRM：多年冻土的微生物组
- Nat Rev Gastroenterol Hepatol: 给医生的菌群分析指南上 下
- PNAS: 干旱延缓高粱根系微生物组的建成并富集革兰氏阳性菌
- PNAS：人类皮肤微生物的独特性和哺乳动物的系统发育共生现象
- NAR：MicrobiomeAnalyst——统计、可视化微生物组数据
- Nature综述：微生物的社交网络 - 营养缺陷型如何塑造复杂群落
- Nature综述：优先效应在生命早期肠道微生物组形成中的作用
- NM：微生物组数据系统发育分析的方法
- Cell综述：人类肠道菌群-从关联到调控
- Cell ：根部微生物跨界的互作促进拟南芥生存
- CHM综述-建立因果关系：合成菌群在植物菌群研究中的机会
- CHM：根瘤菌微生物群落的模块化特征及其与共生根瘤菌的进化关系
- CHM：成年同卵双胞胎的病毒组多样性与肠道微生物组多样性相关
- 对菌群影响药效和毒性的全面总结
- ISME：菌根真菌菌丝分泌物中的果糖作为信号激发解磷细菌活化植酸
- ISME：微生物生态学中的挑战：建立对于群落功能与动态的预测性认识
- FEMS综述: 如何从微生物网络中的“毛线球”理出头绪
- FM：大熊猫的肠道菌群可能并没有特化出发酵纤维素的能力
- NC：免疫组库高通量分析工具：IGoR——更精确剖析免疫组库
- TEE综述：植物—土壤反馈(PSF)：自然和农业科学间的桥梁
- MER：1.8万字带你系统了解宏组学实验与分析
- Microbiome：土壤微生物群落对有机和无机土壤改良剂和细菌入侵的恢复力
综述泛读
- Cell: 宏基因组学成为病毒分类新方法
- NRM：呼吸道菌群—呼吸道健康的守门人
- NRM：真菌的多样性的高通量测序及鉴定
- NP: 可持续农业生态系统中的核心微生物组
- Cell：代谢控制中的脑肠轴
- Cell：人体肠道细菌与自身细胞的比例究竟是多少？
- COM: 土壤微生物组——从宏基因组学到宏表型组学
- ARG：植物微生物组—系统见解与展望
- ARGHG：微生物组与人
- ARPB：微生物组学与植物病害微生物防治
- PNAS：组学重建真菌现有分类系统
- FEMS: 森林微生物组多样性，复杂性和动态变化
- PC：解析宿主基因组和微生物的复杂互作
- Microbiome：植物内部微生物的相互作用
- mBio：微生物组学研究的可再现性、可重现性、稳定性与普适性
- TPS：植物相关微生物群在传统草药中的作用
- NM：微生物与海洋全球变化
- NRG：发表房刚组细菌表观组综述论文
- TM：宿主-细菌界面的MicroRNA：宿主防御或细菌攻击
- NRM： 地球上细菌和古菌的生物膜丰度
- NRM：宏基因组时代的病毒分类
- 叶际微生物定殖模型研究进展
高分文章套路解读
- Nature：益生菌清除致病菌的机制 科普：原来益生菌是这么搞定致病菌的
- Nature: 高通量细菌分离培养鉴定
- Nature：肠道细菌能够调节果蝇运动行为
- Nature：肠道内微生物合作方式的探究
- Nature：根系菌群参与磷胁迫和免疫的平衡
- Nature: EMP揭示地球多尺度微生物多样性
- Nature：环境vs基因，谁对肠道菌群影响更大？
- Nature：人类肠道微生物组的肠型
- Nature：如何做一篇肠道菌群免疫的顶级文章-高盐与高血压
- Nature：肠道菌群代谢物调节肠道与免疫
- Nature: 拟南芥根微生物组的结构和组成
- Nature: 地球上最古老的热液喷口发现早期生命迹象
- Nature: 甘露糖苷选择性抑制致病性大肠杆菌
- Nature：乙酸盐通过介导微生物-脑-β细胞轴促进代谢综合征
- Nature：人工甜味剂改变小鼠肠道菌群组成及功能
- Nature：土壤细菌具有多种合成次级代谢物的基因
- Nature: 海洋病毒对环境基因组和潜在的生物地球化学影响
- Nature：全球表层土微生物组群落结构和功能
- Nature：抗菌药物组合有望特异性治疗耐多药性的细菌感染
- Science: 肠道微生物可以转移到肝脏促进先天性免疫疾病发生
- Science：肠道菌群介导胆汁代谢通过NKT细胞调控肝癌
- Science：微生物群落的构建过程具有趋简性
- NBT：根际微生物组抗番茄枯萎病 PPT思路梳理
- NBT: 宏表观组—DNA甲基化辅助宏基因组binning
- NBT：超高速细菌基因组检索技术
- NBT：宏基因组中设计全面可扩展探针捕获序列多样性
- NG：微生物如何适应植物的？ 评论 正文
- NM:菌群与疾病的关：先有鸡还是先有蛋？
- Gut菌群标志物有望诊断早期肝癌 PPT和视频讲解
- Gut-口腔微生物可以预测直肠癌
- CHM：碳水化合物限制饮食对人类肝脂肪变性的快速代谢益处的综合理解 看“低碳饮食“大法如何降低肝脏脂肪
- CHM：新生儿肠道微生物菌群研究
- CHM:小肠菌群与脂肪的消化和吸收密切相关
- Nmeth: 宏基因组软件评估—人工重组宏基因组基准数据集
- NC.：降低微生物群落复杂度突破组装难题
- NC：宏基因组学提示曙古菌门的代谢和进化(中大李文均组)
- Nmicrobiol：植物根系分泌物影响菌群结构
- Nmicrobiol：丰度决定了细菌在复杂群落中的功能作用
- Nmicrobiol: 四分之一常用的非抗菌药物，居然也会抑制人体肠道菌群？
- Microbiome：微生物组研究中你必须注意的细节
- Microbiome：HiSeq平台16S扩增子文库构建方法
- Microbiome：植物根际微生物组也有昼夜节律
- Microbiome: 简单套路发高分文章–杨树微生物组
- Microbiome：芝麻菜中肠杆菌科主导核心微生物组并贡献抗生素抗性组(简单套路16S+meta+培养组发高分文章)
- Microbiome: 植物生态位和基因型对微生物的影响
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- Microbiome：重新定义“卫生”概念
- Microbiome: 绝对定量环境样本细菌、真菌、真核群落丰度
- Microbiome: 培养组学对已分离人类细菌和古菌物种库的贡献
- Microbiome：空间尺度对华北平原麦田土壤细菌群落的影响(南土所褚海燕组)
- Microbiome: 黄龙病破坏柑橘根部相关微生物菌群从根际到根面的富集过程
- Microbiome：在人工肠道中建立动态线性模型指导设计和分析微生物组研究
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- GigaScience:植物MWAS研究—谷子产量与微生物组关联分析
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- PNAS：病原菌在植物免疫下的转录组
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