RNA-seq流程学习笔记（11）-在Linux系统上使用Miniconda3安装R3.6.3

这两天一直没有更新，一是因为孩子送去幼儿园总是哭闹，心绪不宁；二是因为要学习R语言，自己有点退缩。不过今天终于在R命令行下成功的安装了一个R包，赶紧记录一下吧。

1. 关于后续分析的思路

根据之前网上的RNA-seq各种教程走到这一步，基本上把前期的数据处理完，拿到测序数据的.count文件，即是对reads计数完成了，后续应该对数据进行各种分析、作图；接下来主要使用R和相关的R包进行数据操作。网上教程推荐最简单的办法是在windows上使用R和RStudio进行后续处理。我这个老菜鸟决定逼自己一把，所以暂时不选择windows操作，后面如果扛不住了再说吧，如果有参考我的学习的，可以给自己找个简单的办法。
不过，通过折腾，也能学到新的东西，记录一下吧。

#更新：老菜鸟最终在windows10上进行后续操作，可以直接参考：RNA-seq流程学习笔记（14）

2. 关于R的安装

我自己在之前处理数据的过程中，采用了两个平台：一个是自己工作电脑windows 10系统下的WSL（Ubuntu）子系统，一个是服务器。因此在两个平台都折腾了一下。
前两天浏览清华镜像源网站时，看到了官网推荐到镜像帮助，特意更改了一下自己的镜像源设置：
具体方法参考之前的文章：Linux学习笔记-Anaconda学习笔记
清华镜像源官网给的Anaconda 镜像网址：

因为同事在服务器上使用发现，服务器在安装R包时，会经常报错（可能跟外网被限制所致），所以想着怎么从开始就避免，发现很难。
1. 利用apt install命令在WSL子系统安装R
我自己的WSL子系统中，安装的是ubuntu LTS 20.04版本，里面并没有安装R，系统提示如下：

zexing@DESKTOP-H0I11L9:~$ R
Command 'R' not found, but can be installed with:
sudo apt install r-base-core   
zexing@DESKTOP-H0I11L9:~$ sudo apt install r-base-core
Reading package lists... Done 
Building dependency tree   
Reading state information