将SNP rsID转为基因名的方法

1. 可以使用网站
   https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/snpense
   从Query输入SNP，点击Run query可以得到基因名

2. 运用R软件包

当要转换的SNP很多的时候，用网站不太方便。

软件包’gprofiler2’提供了与 g:Profiler 工具 g：SNPense （https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/snpense） 的接口，该工具将 SNP rs id映射到染色体位置、基因和变异效应。 仅适用于人类变体。
代码：

gsnpense(query, filter_na = TRUE)

参数
query
要翻译的 SNP ID 的向量（应以前缀 ‘rs’ 开头）。

filter_na
逻辑指示是否过滤掉没有 相应的目标名称。

输出是一个 data.frame，它是一个与 Web 界面输出。列 ‘ensgs’ 和 ‘gene_names’ 可以包含多个值的列表。

使用例子：

gsnpense(c("rs11734132", "rs7961894", "rs4305276", "rs17396340", "rs3184504"))

了解更多功能：
https://cran.r-universe.dev/gprofiler2/doc/manual.html