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生物信息学
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安装jupyter notebook时出现Could not build wheels for psutil, argon2-cffi-bindings which use PEP......
安装jupyter notebook时出现错误提示信息:Could not build wheels for psutil......的解决方案原创 2024-01-18 13:47:13 · 589 阅读 · 0 评论 -
python脚本一键重置PDB文件中蛋白的bfactor值
在晶体结构优化过程中,有时候由于蛋白的bfactor过高,蛋白链会出现大片奇奇怪怪差值密度的情况。这时候可以尝试在优化前对bfactor进行重置,奇怪的差值密度可能会有所改善。本文提供了可一键修改PDB文件中bfactor的python脚本。原创 2023-03-16 14:57:15 · 471 阅读 · 0 评论 -
python学习笔记之文件的读取
文件(file): I/O(Input/Output)open函数打开文件,open(‘文件路径’),返回一个文件对象在windows中,系统默认路径为 \,例 D:\17717…而在python中需要将 \ 改为 /,或使用原始字符串,但要在路径前加 r。即:r 'D:\17717… ’file_obj = open(file_name)若用with…as…语句,则等价于:with open(file_name) as file_obj:passwith以后会自动关闭文件,不用手动原创 2020-11-13 22:32:58 · 125 阅读 · 0 评论 -
python学习笔记之类与对象
在开发中经常需要自定义一些对象。根据类来创建对象,对象是类的实例。像int() float() bool() str() list() dict() 都是类,内置类以小写字母开头,自定义类使用大写字母开头。语法:class Myclass(): passmc=MyClass()mc_2=MyClass() #创建了两个对象,均为一类对象,都是MyClass实例isinstance()用来检查一个对象是否是一个类的实例。例如 isinstance(mc, MyClass)类也原创 2020-11-13 21:34:36 · 89 阅读 · 0 评论